Primii misionari crestini în Japonia au apărut în anul 1540 aceștia au fost catolici Iezuiții din Portugalia și franciscanii din Spania . În timp ce noua religie a căpătat succes, feudalii s-au ferit de ceea ce au perceput ca o amenințare imperialistă și au început să-i persecute pe creștini.
Pedeapsa pentru creștini a devenit mai severă și mai sadică în secolul al XVII-lea. Într-o practică cunoscută sub numele de fumi-e, creștinii care erau prinși trebuiau să calce în picioare public imaginea lui Hristos pe cruce, renunțând astfel la credința lor.
Unii au preferat să-și păstreze credința, însă să o practice pe ascuns, sărbătorind Paștele prin introducerea unor elemente japoneze în practic lor religioasă pentru a evita persecuția.
S-a renunțat definitiv la interzicerea creștinismului în 1873. În prezent, circa 1% din populația actuală a Japoniei este creștină, cea mai mare comunitate aflându-se, culmea, în Nagasaki orașul unde persecuția a fost cea mai severă.
In ciuda faptului că în prezent japonezii sunt renumiți pentru modul civilizat în care se comportă în societate , cultura japoneză are rădăcini păgâne șintoiste și budiste de care se simt foarte legați. Într-un video recent o tânără japoneză creștină afirma că japonezii se lasă greu convertiți la creștinism pentru sunt legați de tradiții care venereză pe înaintași, se consideră că încalcă memoria înaintașilor dacă se abat de la tradiții acceptând o religie străină de cultura orientală japoneză.
Creștinii apocaliptici care vorbesc de venirea în curând a lui Anticrist care va aduce cu sine religia mondială cum cred ei că se vor converti japonezii, arabii musulmani care renunță extrem de greu la religia lor la religia lui Anticrist ?
În Japonia în 500 de ani doar 1% din polulația a acceptat să se convertească la creștinism.
În prezent în Japonia există comunități creștine catolice (majoritatea) , ortodoxe dar și circa 7000 de biserici protestante & neoprotestante .
